بیلجیئم میں نشوونما سے متعلق عوارض کے مطالعے میں جینوم سیکوینسنگ سے تشخیص میں بہتری

سپرنگر نیچر کے Genome Medicine میں رپورٹ کی گئی تحقیق کے مطابق، غیر واضح نشوونما سے متعلق عوارض کے شکار 567 افراد پر مشتمل ملک گیر بیلجیئمی آزمائش میں جینوم سیکوینسنگ نے معمول کی جانچ کے مقابلے میں زیادہ تشخیصیں فراہم کیں۔ گروہوں اور ان میں جنس کی تقسیم کے فرق کے لیے ایڈجسٹمنٹ سے پہلے یہ برتری سب سے زیادہ واضح تھی۔

اس مطالعے میں بیلجیئم کے انسانی جینیات کے تمام مراکز کو شامل کیا گیا۔ شرکا کو جینوم سیکوینسنگ (GS) یا معیاری نگہداشت (SoC) حاصل کرنے کے لیے مختص کیا گیا۔ روایتی طریقۂ کار میں ایکسون سیکوینسنگ (ES) کو کروموسومی مائیکروایرے تجزیے کے ساتھ ملایا گیا تھا، یا کم گہرائی والی جینوم سیکوینسنگ استعمال کی گئی تھی۔

GS کے لیے مختص 284 شرکا میں سے 113 کے لیے جینیاتی تشخیص تک پہنچا گیا، جو گروہ کا 39.8% بنتا ہے۔ معیاری نگہداشت والے گروہ میں 283 میں سے 85 شرکا کی تشخیص ہوئی، یعنی 30%۔ یہ فرق شماریاتی طور پر نمایاں تھا، اور GS نے واحد نیوکلیوٹائڈ تغیرات اور چھوٹے اضافوں یا حذفوں سے متعلق 8.7 فیصد پوائنٹس زیادہ کیسز کی نشاندہی کی۔

یہ آزمائش مستقبل نگر (prospective) اور بے ترتیب تھی، اگرچہ اس کی رجسٹریشن سابقہ طور پر کی گئی تھی۔ اس کے نتائج سے ظاہر ہوتا ہے کہ ایسے افراد کے لیے تشخیصی عمل میں جینوم سیکوینسنگ پہلے استعمال کرنے کا ممکنہ فائدہ ہے جن کی نشوونما سے متعلق مشکلات کی کوئی معلوم وجہ نہیں۔

جینوم سیکوینسنگ نے کیا اضافی معلومات فراہم کیں

جینوم سیکوینسنگ پورے جینوم میں جینیاتی مواد کا جائزہ لیتی ہے، جبکہ ایکسون سیکوینسنگ پروٹین بنانے والے حصوں پر توجہ مرکوز کرتی ہے۔ اس مطالعے میں وسیع تر جانچ نے صرف چھوٹی جینیاتی تبدیلیوں سے متعلق تشخیصوں کی تعداد میں اضافہ نہیں کیا، بلکہ اس نے کوڈنگ والے حصوں سے باہر بیماری پیدا کرنے کی ممکنہ صلاحیت رکھنے والے تین تغیرات بھی دریافت کیے، جنہیں محققین نے نان کوڈنگ تغیرات قرار دیا۔

یہ نتائج اس لیے اہم ہیں کہ جب تجزیہ ان حصوں تک محدود ہو جنہیں روایتی طور پر بیماری سے سب سے زیادہ متعلقہ سمجھا جاتا ہے تو جانچ ممکنہ وضاحت سے محروم ہو سکتی ہے۔ تین نان کوڈنگ نتائج نے جانچ کی دونوں حکمت عملیوں کے درمیان پورے فرق کی وضاحت نہیں کی، لیکن انہوں نے GS کے ذریعے دستیاب اضافی نوعیت کی معلومات کا مظاہرہ کیا۔

نتائج سے یہ بھی ظاہر ہوا کہ تشخیص ملنے کا امکان جنس کے لحاظ سے نمایاں طور پر مختلف تھا۔ دونوں مطالعاتی گروہوں کو ملا کر دیکھا جائے تو خواتین میں تشخیصی شرح 45.5% تھی، جبکہ مردوں میں یہ 28.5% رہی۔ مطالعے میں 213 خواتین اور 354 مرد شامل تھے، اور یہ فرق شماریاتی طور پر نمایاں تھا۔

جب محققین نے جنس کی غیر مساوی تقسیم اور دونوں مطالعاتی گروہوں کے تجزیے میں موجود فرق کے لیے ایڈجسٹمنٹ کی تو GS اور معیاری نگہداشت کے درمیان فرق کم ہو کر 7.3 فیصد پوائنٹس رہ گیا۔ اس مرحلے پر یہ فرق شماریاتی اہمیت کے مطالعے میں مقررہ معیار پر پورا نہیں اترا، اور p value 0.069 رپورٹ کی گئی۔

موروثی تبدیلیاں بھی اہم تھیں

تجزیے میں یہ جائزہ لیا گیا کہ جینیاتی تبدیلیاں متاثرہ فرد میں نئی پیدا ہوئی تھیں یا وراثت میں ملی تھیں۔ وہ تغیرات جو والدین میں سے کسی میں بھی موجود نہیں تھے، اور جنہیں de novo تغیرات کہا جاتا ہے، 23.6% شرکا میں پائے گئے۔

موروثی تغیرات نے بھی نمایاں کردار ادا کیا۔ آٹوسومل ڈومیننٹ عوارض سے منسلک جینز میں تبدیلیاں 3.9% تشخیصوں کا سبب بنیں۔ یہ حصہ X-linked تغیرات کے 1.9% کردار سے زیادہ اور آٹوسومل ریسسیو تغیرات کے 4.1% کردار کے قریب تھا۔

یہ موازنہ اس بات سے متعلق ہے کہ جینومی ڈیٹا کا جائزہ کیسے لیا جاتا ہے۔ نتائج سے ظاہر ہوتا ہے کہ آٹوسومل ڈومیننٹ عوارض سے وابستہ موروثی تبدیلیاں بھی تلاش کا حصہ رہنی چاہییں، بجائے اس کے کہ تجزیہ بنیادی طور پر نئی پیدا ہونے والی تبدیلیوں یا وراثت کے دیگر نمونوں پر مرکوز رہے۔

جینیاتی تشخیص کے لیے مضمرات

نشوونما سے متعلق عوارض کے شکار افراد کے لیے ایکسون اور جینوم سیکوینسنگ کو پہلے یا دوسرے درجے کے مالیکیولر ٹیسٹ کے طور پر پہلے ہی تجویز کیا جاتا ہے۔ مسلسل یہ سوال موجود رہا ہے کہ آیا جینوم سیکوینسنگ اتنی اضافی طبی قدر فراہم کرتی ہے کہ ٹیسٹوں کے پہلے سے قائم امتزاج کے بجائے، یا ان سے پہلے، اسے استعمال کرنے کا جواز پیدا ہو سکے۔

بیلجیئمی آزمائش میں GS نے ایک غیر مرکزی ہسپتال کے ماحول اور اچھی طرح متعین قرار دیے گئے گروہ میں ایڈجسٹمنٹ سے پہلے زیادہ تشخیصی شرح پیدا کی۔ یہ ماحول کسی ایک ماہر مرکز سے آگے اس موازنے کو عملی اہمیت دیتا ہے، کیونکہ شرکا ملک بھر میں انسانی جینیات کی خدمات کے نیٹ ورک سے لیے گئے تھے۔

یہ مطالعہ ہر غیر یقینی کو ختم نہیں کرتا۔ ابتدائی نتیجے کے مقابلے میں ایڈجسٹ شدہ موازنہ کم حتمی تھا، جو جنس کی تقسیم اور دونوں حکمت عملیوں کے تجزیے کے طریقے میں موجود فرق کے اثر کو ظاہر کرتا ہے۔ اس کے باوجود، سپرنگر نیچر کی جانب سے رپورٹ کیے گئے مجموعی نتائج غیر واضح نشوونما سے متعلق عوارض کے لیے جینوم سیکوینسنگ کو ایک مضبوط تشخیصی اختیار قرار دیتے ہیں اور نئی اور موروثی، دونوں طرح کی جینیاتی تبدیلیوں کا جائزہ لینے کی ضرورت اجاگر کرتے ہیں۔